หลังจาก "แอล" (เคนอิชิ มัตสึยาม่า) ไขคดีคิระได้สำเร็จ เขายังคงมีคดีสำคัญที่ต้องสะสางให้เสร็จสิ้นภายในเวลา 23 วันที่เหลืออยู่ และเป็นครั้งแรกที่แอลต้องไขคดีเพียงลำพัง โดยไม่มีคู่หูอย่าง "วาตาริ" (ชุนจิ ฟูจิมูระ) เมื่อเด็กหญิง "มากิ" (มายูโกะ ฟูคูดะ) ผู้กุมกุญแจสำคัญในการไขคดีปรากฏตัวขึ้น แอลตกอยู่ในสถานการณ์ที่ยากลำบาก เขาต้องปกป้องเด็ก ๆ ให้ปลอดภัย จากที่เคยใช้เพียงสมองในการไข
คดีผ่านหน้าจอคอมพิวเตอร์ แอลต้องลงมือจัดการด้วยตัวเองแบบตัวต่อตัวเป็นครั้งแรกและครั้งสุดท้าย ผู้ครอบครองอาวุธร้ายจากฝีมือมนุษย์ "มัจจุราช" (เดธ ก๊อด) ได้กล่าวประโยคเดียวกับคิระว่า "ฉันจะเปลี่ยนโลกใบนี้"!!! เกิดอะไรขึ้นกับแอล? สิ่งใดในโลกจะเปลี่ยนแปลงไป? 23 วันสุดท้าย...อันแสนสับสนวุ่นวาย ซึ่งแม้แต่แอลเองก็ไม่อาจกำหนดได้! อะไรกำลังรอเขาอยู่...การนับถอยหลังอันแสนจะตื่นเต้นเร้าใจกำลังจะเริ่มต้นขึ้น ณ บัดนี้
